吸附大孔树脂保存的要求是不失水，去离子水浸泡于阴凉处密封保存，在5-40℃的温度环境中，可以避免水中杂质吸附。如果吸附大孔树脂已经预处理好，没有必要再加酒精浸泡来除杂了。如若不小心脱了水干掉了，应先用浓食盐水(约10%)浸泡，再逐渐稀释，不得直接放于水中，以免树脂急剧膨胀而破碎。
未用过离子交换树脂的保存方法：
在长期储存中，或需在停用设备内长期存放，强型树脂(强酸性和强碱性树脂)应转为盐型，弱型树脂(弱酸性和弱碱性树脂)可转为相应的氢型或游离胺型，也可转变为盐型，以保持树脂性能的稳定。然后浸泡在洁净水中。
停用设备若须将水排去，则应密封，以防树脂中水份散失。离子交换树脂内含有一定的平衡水份，在储存和运输中应保持湿润，防止脱水。树脂应储存在室内或加遮盖，环境温度以5℃-40℃为宜。袋装树脂应避免直接日晒，远离锅炉、取暖器等加热装置，避免脱水。
若发现树脂已有脱水现象，切勿将树脂直接放于水中，以免干树脂遇水急剧溶胀而破碎。应根据其脱水程度，用10%左右的食盐水慢慢加入到树脂中，浸泡数小时后用洁净水逐步稀释。当环境温度在0℃或以下时，为防止树脂因内部水份结冰而崩裂，应做好保温措施，或根据气温条件，将树脂存于相应浓度的食盐水中，防止冰冻。若发现树脂已冻，则应让其缓慢自然解冻，切不可用机械力施于树脂。
使用过的离子交换树脂保存方法：
长期停用而放置在交换器内的树脂，为防止微生物(如藻类、细菌等)对树脂的不可逆污染，树脂在停用前须彻底反洗，以除去运行时积聚的悬浮物质，并注意定期冲洗和换水。
阴树脂：用3倍树脂体积的10% NaCl + 2% NaOH混合液分两次通过树脂层，每次静止浸泡数小时，然后将其排去。如有必要，在重新启动前用2倍树脂体积的0.2%过氧化氢(H2O2)溶液淋洗树脂层。
阳树脂：在阳离子交换器及管系内可充入0.5%的甲醛溶液，并在停用期间保持此浓度。也可用食盐水浸泡。在设备重新启动前用0.2%过氧化氢或0.5%甲醛溶液淋洗。
